河川システムの生物相は、一般に、河川景観を特徴づける縦方向（上流から下流）、横方向（陸域から水域）、垂直方向、および時間勾配の中に分布している。土壌生物の多くの種は、河川ネットワーク内の特定の場所でしか発生しない特定の環境条件に適応している。例えば、水生昆虫のある種は、滝のように流れる渓流の冷たく岩の多い環境に適応し、他の種は、ほとんどの河川システムの特徴である暖かく砂質で濁った環境に適応している。
土壌生物相は、貯水・浸透、土壌侵食の抑制、栄養同化、土壌肥沃度、ミネラル循環など、陸上生態系に広範な生物サービスを提供している。土壌生物相の分布は、気候、地質学的歴史、基盤の複雑さなど、さまざまな要因に影響される。また、土壌生物相の分布は、土壌団粒や間隙網の大きさや形状、土壌有機物の種類や量など、基礎となる基盤の物理的特性にも影響される。
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